윤여준, 박성렬, 박제원, 송재경 "새로운 카나마이신 화합물, 카나마이신 생산 스트렙토마이세스 속 미생물 및 카나마이신의 생산 방법" 한국 특허등록 제 10-1272351호 (2013.05.31) / 출원번호 제 10-2010-0082418 (2010.08.25)

윤여준, 모상준, 유영지, 반연희, 이성권, 김은지, 서주원, 김재종, 임시규 "ＦＫ506 또는 ＦＫ520의 생산능이 향상된 미생물 및 이를 이용한 ＦＫ506 또는 ＦＫ520의 대량 생산 방법" 한국 특허등록 제10-1263597 호 (2013.05.06) / 출원번호 제 10-2011-0114170 (2011.11.03)

윤여준, 김재종, 임시규 "Novel Tacrolimus Analogues, a Neuroprotective Composition Comprising the Same, an Immunosuppressive Composition Comprising the Same, a Method for Preparing the Same, and a Mutant for Producing the Same" 미국출원 Application No. 13/774,899 (2013.02.22)

윤여준, 박제원, 박성렬 "신규한 올리고마이신 유도체 및 이를 포함하는 항생제" 한국 특허등록 제 10-1231289호 (2013.02.01) / 출원번호 제 10-2010-0079101 (2010.08.17)

윤여준, 모상준, 박제원, 반연희, 유영지, 임시규, 김동환, 유정현, 이금순 "스트렙토미세스 균주로부터 에프케이506을 제조하는 방법" 한국 특허등록 제 10-1228031호 (2013.01.24) / 출원번호 제 10-2009-0078708 (2009.08.25)

윤여준, 박성렬, 박제원, 송재경 "A New Kanamycin Compound, Kanamycin-producing Streptomyces Species Bacterium, and Method of Producing Kanamycin" 유럽출원 European Patent Application No. 10850313.7 (2012. 11. 21) / 2017.01.02 등록진행중

윤여준, 박제원 "신규한 트리코스타틴 유도체 및 이를 포함하는 항암제" 한국 특허 등록 제 10-1189756호 (2012.10.04) / 출원번호 제 10-2010-0096108 (2010.10.01)

윤여준, 박성렬, 윤진아, 백지혜, 박제원 "방선균에서의 페닐프로파노이드 화합물의 생산방법" 특허 등록 제 10-1053025 호 (2011.07.26) / 출원번호 제 10-2008-0112502 (2008.11.13)

윤여준, 박성렬, 박제원, 송재경 "New kanamycin compound, kanamycin-producing Streptomyces sp. and kanamycin producing method" PCT특허출원 PCT/KR2010/007041 호 (2010.10.14)

윤여준, 한아름, 박제원, 김은지, 박성렬, 정원석 "안트라사이클린 계열 항암제 에피루비신의 생합성 방법 , 안트라사이클린 계열 신규 당치환체 및 그 제조 방법" 한국 특허 등록 제 10-0989238 호 (2010.10.14) / 출원번호 제 10-2008-0017742 (2008.02.27)