윤여준, 박한오, 정소선, 송재경, 김응수, 김은지, 김은지, 나희주 "에포틸론 발현 카세트 및 이의 용도" 한국 특허 특허등록 제 10-1606635 호 (2016.03.21) / 특허출원 제 10-2014-0067238호 (2014.06.02)

윤여준, 박한오, 정소선, 송재경, 김응수, 김은지, 김은지, 나희주 "에포틸론 발현용 벡터 및 이의 용도" 한국 특허 특허등록 제 10-1601424 호 (2016.03.02) / 출원번호 제 10-2014-0067240호 (2014.06.02)

윤여준, 박성렬, 박제원, 송재경 "A New Kanamycin Compound, Kanamycin-producing Streptomyces Species Bacterium, and Method of Producing Kanamycin" 미국특허등록 (2015.09.15) US 9,133.492 / 미국출원 Application No. 13/642,842 (2012. 12. 18)

윤여준, 반용선, 권효정, 반연희 "FK506 유도체를 함유하는 크립토코쿠스 속 곰팡이 및 간디다 속 곰팡이에 의한 진균 감염을 치료하기 위한 약제학적 조성물 및 그의 용도" PCT특허출원 PCT/KR2015/006635 (2015.06.29)

윤여준, 유영지 "rapＸ 또는 rapＷ를 과발현하는 방선균주 및 이를 이용한 라파마이신 생산성 증대방법" 한국 특허 특허등록 제 10-1525309 호 (2015.05.27) / 출원번호 제 10-2013-0100997호 (2013.08.26)

윤여준, 반연희, 안은영, 한규범 "신규한 사이토크롬 Ｐ450 수산화효소 및 이를 이용한 수산화된 사이클로스포린 Ａ의 생산방법" 한국 특허 특허등록 제 10-1459817 호 (2014.11.03) / 출원번호 제10-2012-0002330호 (2012.01.09)

윤여준, 한아름, 이동건 "신규 나르보마이신 유도체 화합물, 상기 화합물을 포함하는 항균용 조성물 및 상기 화합물의 생산 방법" 한국 특허등록 제 10-1451037 호 (2014.10.07) / 출원번호 제 10-2013-0148025호 (2013.11.29)

윤여준, 한아름, 이동건 "신규 나르보마이신 유도체 화합물, 상기 화합물을 포함하는 항균용 조성물 및 상기 화합물의 생산 방법" 한국 특허등록 제 10-1347335호 (2013.12.26) / 출원번호 제 10-2011-0035384 (2011.04.15)

강태원, 유성선, 이유원, 윤여준, 유영지 "증가된 라파마이신 생성능을 갖는 신규 미생물 균주" 한국 특허등록 제 10-1331491호 (2013.11.14) / 출원번호 제10-2012-0028776호 (2012. 03. 21)

윤여준, 박성렬, 박제원, 송재경 "새로운 카나마이신 화합물, 카나마이신 생산 스트렙토마이세스 속 미생물 및 카나마이신의 생산 방법" 한국 특허등록 제 10-1272454호 (2013.05.31) / 출원번호 제 10-2012-0138931 (2012.12.03)